东莞流水线为了实现同一个时间内可以实现两个或两个以上的操作，就要确保流水线要保持通畅，让任务充分的分配到每一个工位上，但是在实际操作中，会有2两种情况会使流水线停下来或不能启动：
1、多个任务在同一个时间周期内争用同一个流水段。例如，在东莞流水线指令中，如果数据和指令是放在同一个储存器中，并且访问接口也只有一个，那么，两条指令就会争用储存器，在一些算数流水线中，有些运算会同时访问一个运算部件，这样就会造成多个任务在同一个时间周期内争用同一个流水线段，影响了东莞流水线的性能。
2、数据依赖，举个例子，A运算必须得到B运算的结果，但是，如果B运算还没有开始，A运算动作就必须等待，因此两侧运算不能同时执行。
这两种情况的出现都会影响东莞流水线的性能，但是我们也不需要担心，因为对于第一种情况，我们可以增加运算部件数量来使他们不必争用同一个部件，而第二种情况，我们可以用指令调度的方法来重新安排指令或运算的顺序。